MIHO MUSEUMで使用される食材は、肥料、農薬などを一切使用せず、秀明自然農法の理念に基づいて生産されたものです。現在、秀明自然農法の圃場は日本国内にとどまらず、海外でも北米、ヨーロッパ、フィリピン、台湾、香港、アフリカ、ブラジルなどにあります。
秀明自然農法は自然に順応した農耕法です。アメリカ・コロラド州にある低温乾燥の高地やザンビアの乾いた台地など、さまざまな地形や気候を調査し、その実施方法は進化発展を続けています。